为满足日益增长的临床需求，神经病理中心一直积极开展分子病理检测项目，尤其自2021年第五版WHO中枢神经系统肿瘤分类指南（简称WHO CNS5）发布后，我们迅速启动了DNA甲基化谱分析项目，并与2023年7月在院内通过了新技术新项目评审，正式进入临床检测。
目前检测平台日益完善，包括焦磷酸测序平台、荧光原位杂交平台、荧光定量PCR平台、二代测序平台，以及具有独立知识产权的国内首个DNA甲基化谱分析平台（该平台既可以对中枢神经系统肿瘤进行准确分类，又可防止国人遗传信息资源外泄），处于国内中枢神经系统肿瘤分子病理检测的领先地位。现已完成分子病理检测1万余例，为中枢神经系统肿瘤的诊断、分级、治疗和预后评估提供了重要依据。
下面将神经病理中心目前开展的分子病理检测项目进行简要介绍，并在文末附：中枢神经系统肿瘤分子病理检查流程（附件一）和WHO CNS5 指导下的神经病理报告（附件二）。
目前神经病理中心开展的分子病理检测项目包括：
一、MGMT启动子甲基化
检测方法：焦磷酸测序法（PSQ）
检测意义：具有MGMT启动子甲基化的患者对替莫唑胺更加敏感
二、染色体缺失/扩增、基因拷贝数缺失/扩增及基因融合
检测方法：荧光原位杂交法（FISH）
检测内容：目前开展的FISH项目包括染色体1p/19q缺失、7号染色体扩增、基因拷贝数缺失/扩增（CDKN2A、EGFR、MYCN、MDM2、CDK4等）、基因融合（MYC、CIC、RELA、MN1、FOXR2、EWSR1、BRAF等）。
三、神经系统肿瘤精准诊疗基因检测（V1.0）（DNA）
检测方法：二代测序法
检测内容：该panel整合了多平台多分子靶标的高通量靶向测序项目，基因列表如下：
检测意义： 1.预测诊断分型 2.预测临床预后 3.预测药物有效性
四、儿童肿瘤精准诊疗基因检测（DNA+RNA）
检测方法：二代测序法
检测内容：该panel最大优势是包括＞1700种融合基因形式，基因列表如下：
检测意义：1.预测诊断分型 2.预测临床预后 3.预测药物有效性
五、DNA甲基化谱分析
检测方法：DNA甲基化谱分析法
检测内容：通过甲基化芯片检测对全基因组935K个位点的甲基化水平进行分析，并基于甲基化分析结果进行中国人群数据库比对，从而对中枢神经系统肿瘤进行分类。
DNA甲基化谱分析结果包含了MGMT启动子甲基化状态（该结果是评价患者对替莫唑胺药物敏感性的重要因素）、DNA甲基化谱聚类情况（该结果会提示肿瘤的分类情况，帮助医生做出整合病理诊断）以及拷贝数变异情况（扩增或缺失）。举例如下：
检测意义：WHO推荐的有效且重复性高的中枢神经系统肿瘤分类方法，可为肿瘤整合诊断提供重要的参考和依据。尤其对于组织特征不显著、常规分子病理检测无法明确以及罕见的肿瘤类型和亚型，DNA甲基化谱分析是（目前）确定其诊断的唯一方法。
附件
附件一：中枢神经系统肿瘤分子病理检查流程
值得注意的是，准确的分子病理诊断离不开准确的组织病理学诊断。标本的病理评估极其重要，因为脑肿瘤组织存在很大的异质性，只有选出合适的病理蜡块做分子病理检测，才能保证分子病理报告的准确性和可信性。
附件二：WHO CNS5 指导下的神经病理报告
